- $item = $List.GetItemById(1)
 - $file = $web.GetFile($item.Url)
 - $file.MoveTo($item.ParentList.RootFolder.Url + "/Folder/" + $item.ID +"_.000")
 
Here is my script sequence. 
PS N:\> $item = $List.GetItemById(5)
PS N:\> $item.ResetRoleInheritance()
PS N:\> $file = $web.GetFile($item.Url)
PS N:\> $file.MoveTo($item.ParentList.RootFolder.Url + "/XXFOLDER/" + $item.ID +"_.000")
PS N:\> $item = $List.GetItemById(6)
PS N:\> $item.ResetRoleInheritance()
PS N:\> $file = $web.GetFile($item.Url)
PS N:\> $file.MoveTo($item.ParentList.RootFolder.Url + "/XXFOLDER/" + $item.ID +"_.000")
PS N:\>